Федерация Независимых Профсоюзов России образована в 1990 году. ФНПР является самым крупным профсоюзным объединением трудящихся России.

Федерация объединяет 41 общероссийский профсоюз на правах членских организаций и 8 профсоюзов, строящих свои взаимоотношения с ФНПР на основе договоров. Во всех республиках, краях, областях Российской Федерации действуют 79 территориальных объединений организаций профсоюзов, которые наряду с отраслевыми профсоюзами являются членскими организациями ФНПР. В общей сложности членские организации ФНПР объединяют около 25 млн. членов профсоюзов (более 95 процентов всех членов профсоюзов в стране).

В Федеральных округах России взаимодействие с законодательными и исполнительными органами власти осуществляют секретари ФНПР. В рамках ФНПР действуют Ассоциации профсоюзов, объединяющие работников непроизводственной сферы, трудящихся базовых отраслей, рабочих оборонной промышленности, машиностроения, транспорта, действующих в сфере предпринимательства и малого бизнеса.

Высшим органом ФНПР является съезд. Очередной - VI съезд ФНПР состоялся в ноябре 2006 года. В период между съездами деятельностью ФНПР руководит Генеральный совет, заседания которого проводятся не реже двух раз в год. Для оперативного руководства деятельностью Федерации из числа членов Генсовета ФНПР избирается Исполнительный комитет ФНПР. Председателем Федерации Независимых Профсоюзов России с 1993 года избирается Михаил Викторович Шмаков.

Программный документ ФНПР, принятый VI съездом Федерации и носящий название «За достойный труд»,  определяет перспективные задачи Федерации.  Это -  доведение  заработной платы в России до уровня среднеевропейского, обеспечение занятости трудоспособного населения, безопасных условий труда,  достойных пенсий,  соблюдение государственных социальных гарантий,  рост уровня жизни трудящихся и членов их семей.

ФНПР участвует на экспертном уровне в разработке проектов федеральных и региональных законов, касающихся социально-трудовой сферы, соблюдения прав профсоюзов и трудящихся. Действуя в этом направлении,  ФНПР активно влияет на процесс совершенствования российского законодательства, в том числе через своих представителей в Государственной Думе – межфракционную депутатскую группу «Солидарность». Одним из наиболее значительных эпизодов этой работы стало принятие и совершенствование Трудового кодекса РФ.

Правовые службы ФНПР и ее членских организаций постоянно участвуют в судебных заседаниях, разрешающих трудовые споры и конфликты. Практика показывает: там, где работают профсоюзные юристы, - там   более 90% исков членов профсоюзов судами удовлетворяется.

Свой стратегический курс ФНПР всегда связывала с полноценной реализацией механизма социального партнерства. В его основу положен принцип заключения коллективных договоров на предприятиях, отраслевых и региональных трехсторонних соглашений. Практически на всех предприятиях, на которых действуют первичные организации профсоюзов, входящих в ФНПР, заключены коллективные договоры.  

ФНПР играет ведущую роль в деятельности профсоюзной стороны Российской трехсторонней комиссии по регулированию социально-трудовых отношений. Из 30 мест профсоюзной стороны РТК ей принадлежат 24. Координатором профсоюзной стороны РТК избран Председатель ФНПР М.В. Шмаков. В рамках работы комиссии регулярно заключаются Генеральные соглашения между общероссийскими объединениями профсоюзов, общероссийскими объединениями работодателей и Правительством Российской Федерации.

ФНПР и ее членские организации настойчиво ищут пути реализации интересов членов профсоюзов в рамках переговорного процесса и только в крайнем случае прибегают к организации коллективных действий. Миллионы россиян принимают участие в проводимых под эгидой ФНПР акциях протеста.

Из наиболее крупных выступлений российских трудящихся под эгидой ФНПР следует отметить Всероссийскую акцию протеста осенью  1998 года “Нет — губительным экономическим реформам!”, в которой  участвовало более 25 млн. человек.   

В апреле – мае 2007 года страну всколыхнули  три этапа  коллективных действий, проведенных  ФНПР под общим лозунгом «За соблюдение прав трудящихся! За достойную жизнь!». В поддержку требований ФНПР был проведен сбор миллионов подписей в трудовых коллективах.

С 2008 года ФНПР активно включилась в глобальную международную кампанию: Всемирный день действий «За достойный труд!» 7 октября. Перед лицом вызовов мирового кризиса российское и международное профсоюзное движение демонстрируют солидарность и сплоченность своих действий.  С 5 по 9 октября 2009 года в России прошли собрания  в первичных профсоюзных организациях с единой повесткой дня «Достойный труд – достойное будущее!». В организованной  ФНПР массовой акции приняли участие свыше 8 млн. трудящихся.

Многомиллионные первомайские шествия и митинги российских профсоюзов, объединенных ФНПР, ежегодно демонстрируют силу и сплоченность профсоюзного движения России.

Наступление российских профсоюзов будет продолжаться до тех пор,  власти не выполнят их справедливые требования по обеспечению достойной жизни для большинства россиян.

Во многом благодаря протестным действиям профсоюзов удается сдерживать неконтролируемый рост тарифов на жилищно-коммунальные услуги, повышать уровень оплаты труда, заставлять власти садиться за стол переговоров по вопросам обеспечения занятости и охраны труда, соблюдения надлежащих государственных социальных гарантий.

ФНПР  имеет развитую систему профсоюзного образования. В нее входят два высших учебных заведения - Академия труда и социальных отношений в Москве и Санкт-Петербургский гуманитарный университет профсоюзов. Расширяется сеть их филиалов, которые в настоящее время функционируют в десятках регионов России, а также в странах СНГ. Успешно действуют также 45 учебно-методических центров профсоюзов.

Большое внимание ФНПР уделяет сотрудничеству с профсоюзными центрами стран - членов СНГ. Российский профцентр является членом Всеобщей Конфедерации Профсоюзов (ВКП). Президентом ВКП избран Председатель ФНПР М.В.Шмаков.

ФНПР активно сотрудничает с Международной организацией труда (МОТ), поддерживает братские отношения с профцентрами более 100 стран мира. ФНПР является членом Международной конфедерации профсоюзов (МКП), объединившей в своих рядах 168 миллионов человек, 304 национальных профцентра из 153 стран мира. Кроме того, ФНПР вошла в состав Всеевропейского регионального совета  МКП (ВЕРС). Президентом ВЕРС избран Председатель ФНПР Михаил Шмаков.